• الثوابت الشرعية : استشعار شرف المكان، وقدسية المدينة المنورة في الشريعة الإسلامية.

  • المواطنة: الارتقاء بالخدمات المقدّمة ,وتعزيز الانتماء الوطني, لتتوافق والرؤية الوطنية لخدمة العلم والمتعلمين.

  • الجودة والتميّز: قياس الأداء من خلال تطبيق المعايير العلمية المتوافقة مع مستوى التطلعات.

  • الالتزام بالوقف: مراعاة شروط الواقف في أعمال المركز.

  • التطوير: إعمال الفكر في تجديد الوسائل والأدوات؛ لإحداث برامج نوعية ومتجددة، وفق مؤشرات أداء كل مرحلة.

  • الأمانة العلمية: الالتزام بالمنهجية العلمية الصحيحة في إجراء البحوث وتوثيق المعلومات.

  • المسئولية الاجتماعية: مشاركة الجهات العلمية، والقطاعات الحكومية والأهلية، في تقديم الخدمة المميزة لمجتمع المدينة المنورة.

  • القيادة والعمل الجماعي: تنمية المهارات القيادية بالمركز وتكامل الأدوار الفردية والجماعية.